رسالة المركز تقوم على أساس توعية المسلمين بقضية فلسطين من الناحية العلمية والعملية على أساس من الكتاب والسنة بفهم السلف الصالح ونشر المنهج السلفي بين أوساط الشعب الفلسطيني بخاصة والمسلمين عامة.
تأسست جمعية المقاصد الخيرية الإسلامية في بيروت منذ قرن وربع القرن سنة 1795هـ 1878م وهي جمعية خيرية إسلامية لا تبغي الربح تسعى لإنشاء مجتمع مقاصدي متميز مبني على القيم السامية فخور بانتمائه الوطني.